脚本：福井晴敏・岡秀樹／絵コンテ：麻宮騎亜／演出：小谷野竜成／総作画監督：前田明寿／作画監督：石原満・山根理宏・那花優統

ズォーダーの意志で［滅びの方舟］は目覚めた。都市帝国の残骸を喰らい、真の姿へと変貌を遂げる［滅びの方舟］。地球を覆わんばかりの超巨大な姿となった［滅びの方舟］に対峙する、満身創痍のヤマト。もはやヤマトに戦う力は残されていない。艦長として古代は、最後の決断を下す。

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